对食品生产企业实行生产许可证制度，是从源头上加强食品质量安全监督管理，保障人身安全健康的重大举措，虽然有一些经验可以借鉴，但也有大量的工作还需要在实践中不断探索。因此，在食品生产许可管理工作中，必须坚持国家质检总局统一管理，合理确定各级质量技术监督部门的职责，充分发挥质量技术监督部门在颁发《食品生产许可证》工作中的职责分别如下：
（1）国家质检总局的主要职责：
①负责制定并公布《食品质量安全监督管理重点产品目录》，制定并发布各类食品生产许可证实施细则等规范性文件；
②受理有特殊规定的食品生产加工企业提出的《食品生产许可证》的申请；
③负责统一印制《食品生产许可证》证书并加盖质检总局印章，颁发《食品生产许可证》。统一公告取得《食品生产许可证》企业名单和撤消《食品生产许可证》企业名单等有关信息。
（2）各省、自治区、直辖市质量技术监督局的职责：
①组织实施受理《食品生产许可证》申请、审查申请取证企业的生产条件和《食品生产许可》的发放工作；
②组织、指导市（地）级局受理《食品生产许可证》申请、审查申请取证企业的生产条件等工作；
③负责汇总申请取证企业的材料，并将符合发证条件的企业名单及有关材料报国家质检总局批准。
（3）市（地）级质量技术监督部门的职责：
受理《食品生产许可证》申请、组织审查申请取证企业的生产条件等工作，并将审查情况报省级质量监督部门汇总。
（4）县级质量技术监督部门的职责：
在省级、市（地）级质量技术监督部门的组织下，承担企业保证产品质量必备条件的调查工作，参与《食品生产许可证》申请取证企业生产条件审查等工作。