（一） 微波热效应
1、使微生物快速升温导致菌体蛋白质变性，活体死亡；
2、使微生物生命活动受到严重干扰，无法繁殖；
3、导致细胞膜破裂，使生理活性物质发生变性作用，而失去生理功能；
4、破坏微生物的生存繁殖条件而导致其死亡。

（二） 微波非热效应
1、光化学反应
2、场力效应
3、电磁共振效应
4、影响遗传物质DNA的含量