本纲细菌种类庞杂。现依取得能量时所氧化的化合物性质，将本纲分为化能无机营养菌和化能有机营养菌两类。前者氧化氨、亚硝酸、硫化物和元素硫等无机物取得能量，以二氧化碳为唯一的碳源，如硝化杆菌科和硫杆菌属的细菌；后者仅能氧化有机物取得能量，并以其为碳源，如肠杆菌科和拟杆菌科的细菌，其中有的可在自然界中营腐生生活（如螺菌），有的营共生生活（如根瘤菌），有的营寄生生活（如奈瑟氏球菌、黄单胞菌），另外还有专性细胞内寄生菌如立克次氏体目的细菌。依照取得化学能的代谢途径，可分为发酵性细菌和呼吸性细菌，前者营发酵代谢（如拟杆菌科和韦荣氏球菌科的细菌）；后者营呼吸代谢，其中有的以分子氧为最终电子受体（如假单胞菌），有的以氧化性的无机盐为最终电子受体（如硫酸盐或硝酸盐），而脱硫弧菌则以硫酸盐为最终电子受体行厌氧呼吸。

　　本纲细菌有球状（奈瑟氏球菌属）、杆状（假单胞菌属）和螺旋状（螺菌属）。大多数种类的细胞单独或成对生存，不形成细胞集合体。有些种类的细胞相连成链，并裹以外鞘形成长丝（如球衣菌）。有的种类细胞连同所分泌的粘液如粘孢子形成多种形态的子实体（如粘细菌目）。这一现象在原核生物中是仅有的。本纲内大多数种类的细胞壁是刚硬的，但有些种类的细胞壁是柔软的，菌体可以屈挠（如粘细菌目、噬纤维菌目和螺旋体）。有的种类能形成胞囊（如固氮菌）或形成粘孢子（如粘细菌目的成员），但没有形成内生芽孢的种类。本纲细菌运动或不运动，运动的或在界面上滑行、或在液体中用鞭毛游动。

　　由于本纲细菌间的亲缘关系难以确定，目前还没有一个完整的分类系统。

　　本纲细菌有些是人类和动物的致病菌，如引起霍乱的霍乱弧菌、引起伤寒的伤寒沙门氏菌、引起脑膜炎的脑膜炎奈瑟氏球菌、引起多种动物流产的布鲁氏菌、引起人和动物钩端螺旋体病的钩端螺旋体、引起人和动物多种脓肿的拟杆菌；有些是植物的致病菌，如引起蔫萎的黄单胞菌、引起青枯病的青枯假单胞菌、引起软腐病的胡萝卜软腐欧文氏菌等。有的可用于工农业生产，如用于湿法冶金的氧化硫硫杆菌、与豆科植物共生固氮的根瘤菌；有的可用于污水处理，如动胶菌、球衣菌和排硫硫杆菌等。