预防平菇病毒病，可采取以下措施：（1）选用无病毒的菌种，严格把好母种关。凡生长异常，特别是菌丝不整齐的母种要剔除；原种、生长种在培养阶段要经常检查，凡菌丝有缺刻或花斑块的要坚决淘汰。（2）菇棚、培养室、接种工具要严格消毒。（3）感染病毒病的平菇菌袋要挑出隔离并烧毁。生产结束后对患病的菇房进行严格的消毒，将菇床架拆开清洗，防止携带病毒的孢子和菌丝潜伏在架缝中。