分类系统上设在种下的等级。在植物中，有些植株的性状与基本种不同，而以往是以花色（大部分的白花）、株形（垂樱）、叶形等某一性状的差异来划分变种，但最近，作为一个品种来考虑，则至少要有两三点差异，并且占有不同的地理分布的类型才常作为变种来处理。在动物分类上存有轻视变种的倾向，动物的变种常有一部分被作为品种处理，在地理分布上不同的多作为亚种处理。命名上是把加有var．符号的变种小名附在种名之下来表示，不能单用变种小名来表示。变种小名的规定与种名的规定是一样的。如日本垂樱是江户彼岸樱（Prunus itosakura）的变种，但在命名上相反地则采取把江户彼岸樱为前者的变种型（Prunus Pendula var．ascendens）。