是一种遗传的多态现象。在群体中，受等位基因决定的蛋白质在氨基酸排列等方面同时存在着两种以上的变异，称为蛋白多态现象。但当等位基因中最高频率超过99％时，一般就不称为多态现象。如果专指酶时则称为酶的多态现象或称为同功酶多态现象。由于大都是用电泳法来检出变异的，所以这样的变异亦称为电泳变异（electrophoretic variant）。一般用杂合体频率来表示群体中蛋白多态的变异量，但是群体中所含的等位基因数在考虑整个基因组时，以显多态现象的基因座位的比率和平均杂合体的频率来表示较为适宜。蛋白多态是群体遗传学和分子进化的重要研究对象。