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比较项目 |
化学合成 |
体外转录 |
RNase III降解dsRNA |
siRNA |
PCR |
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材料需求 |
21-mer RNA |
29-mer DNA oligos(一对) |
转录模版 (200-1000bp，两侧带T7 启动子) |
55-60-mer DNA oligos(一对) |
~50-mer DNA oligos(一对) |
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全部制备/合成时间所需时间 |
4天—2周 |
24 小时 DNA oligo合成时间 |
1 天 转录模版制备时间 |
5天以上 DNA oligo合成时间 |
~ 6 小时 DNA oligo合成时间 |
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个人所需操作时间 |
几乎不需要* |
中等 |
中等 |
多 |
中等 |
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是否需要验证和寻找最有效siRNA |
需要 |
需要 |
不需要 |
需要 |
需要 |
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能否标记siRNA (例如用于荧光显微镜分析siRNA进入细胞过程或者在细胞中的定位） |
能 |
能 |
能 |
不能 |
不能 |
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转染的相对难易程度 |
好 |
好 |
好 |
差 |
差 |
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可筛选性 (例如抗生素筛选) |
不可以 |
不可以 |
不可以 |
可以 |
不可以 |
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能否用于长效抑制 |
不可以 |
不可以 |
不可以 |
可以（抗生素筛选） |
不可以 |
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能否大规模制备 |
可以 |
有限 |
有限 |
可以 |
有限 |
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检测总体转染效率 |
不可以 |
不可以 |
不可以 |
可以 |
不可以 |
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每个基因的相对费用（不包含人力） |
高 |
中等 |
低 |
中等 |
中等 |
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*取决于合成后是否包含纯化、去保护，以及厂家提供的是已经退火的即用型双链还是冻干的单链 |
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