由于各类食品特性不同，所以抽样方法及运送要求也有所不同，应按照各类《实施细则》中规定的办法进行。
一般情况下，抽样要在企业的成品库的待销产品中随机进行，产品要有一定的数量（要大于规定的抽样基数）。抽样方法要使所抽取的样品有代表性，抽样数量应能满足检验、复检的需要。抽样过程要有企业代表参加，抽样完成后将样品封好，填写抽样单，抽样人员和企业代表要在抽样单上签字，并加盖企业的公章。样品由企业或审查人员在指定时间内安全（无破损、无变质、保持封条完好）地送到检验机构。如果在运送过程中有破损、变质或封条不完整的现象，检验机构有权拒绝接收样品。
以食醋产品的抽样为例。
审查组在现场审查合格的同时，应在企业成品库内进行抽样。所抽样品必须为同一批次的产品，抽样基数不得少于200瓶（袋），随机抽取12瓶（袋），样品分成两份，每份为6瓶（袋）。样品确认无误后，填写产品抽样单（见实施细则），一式3份。样品包装，并在包装的相应开口处贴上封条。包装好的样品一份送检验机构检验，一样留在企业作为备用样；在抽样后的10个工作日内，由该企业或审查组将样品安全送达指定的机构。