审查组开展现场审查工作主要包括以下5个基本程序：
（1）召开首次会议。会议由审查组全体人员及被审查企业的领导和有关人员参加。会议由审查组组长主持，介绍审查组成员，说明审查的内容、审查计划，并要求企业进行必要的协助；说明审查组的工作纪律，将“企业生产必备条件审查工作廉洁信息反馈表”交企业负责人，明确企业有权对审查工作组的廉洁性和公正性进行监督。企业领导介绍企业情况。
（2）现场审查。现场审查的内容按“食品生产企业必备条件审查内容及要求”表中的内容进行审查。审查组成员按照分工同时开展工作，将审查结果记录在“食品生产企业必备条件审查内容及要求”表中。表达方式为“符合”、“基本符合”、“不符合”、“暂不考核”4种。如果有的项目审查结果是“基本符合”或“不符合”，就要填写“食品生产企业必备条件现场审查不符合项报告”表，在表中写清楚是什么项目不符合或有不足，并由企业负责人签字认可。同时要提出对不符合或有不足项的改进意见。
（3）产品抽样。抽样的样品应是企业的代销产品，一般在成品库内进行。样品的抽样方法、数量的等要求应按各类食品生产许可证实施细则中的规定进行。填写产品抽样单，样品封好后，由企业到规定时间内安全送到指定的质检机构。
（4）审查组会议。确认审查记录，核对审查记录的完整性；对分歧意见的讨论和处理；草拟审查报告和审查结论。
（5）末次会议。现场具体审查工作完成以后，召开末次会议。会议由审查组全体成员及被审查的企业领导和有关工作人员参加。会议由审查组组长主持，与企业就审查情况进行沟通，指出不符合或不足的项目，向企业提出改进建议。