为了在遗传学、肿瘤学、免疫学及生理学等广泛的领域中进行医学生物学的研究而培育的纯系动物。以小鼠最多，有A系、CBA系及C3H系等数百个系统。此外也曾培育出兔、土拨鼠、狗和鸡的纯系。在古典的遗传学常用果蝇或蚕蛾为纯系。为了培育纯系，要连续作20代以上的同亲雌雄间的交配（兄妹交配），使99％以上的基因保持同型状态，这种把继续保持同亲个体间交配的系统称为近交系（inbredstrain）。作为纯系来说其可靠度最高，因在纯系内个体间没有基因变异，故可能进行组织或肿瘤的移植。另外在纯系中有的可发生特定的疾病（各种肿瘤、自身免疫病、高血压及糖尿病等），这也是人工选择的结果，是医学上基础研究的重要材料。