土壤中的钼来自含钼矿物，而主要含钼矿物是辉钼矿。含钼矿物经过风化后，钼则以钼酸离子（MoO42-或HMoO4-）的形态进入溶液。土壤中的钼从目前资料可区分成四部分： （1）水溶态钼。包括可溶态的钼酸盐。其含量甚微，一般不容易测定出来。（2）代换态钼。MoO4-2离子被粘土矿物或铁锰的氧化物所吸附。以上两部分称为有效态钼是植物能够吸收的。（3）难溶态钼。包括原生矿物、次生矿物、铁锰结核中所包被的钼，植物是难以吸收的。 （4）有机结合态的钼。钼原子价很多，最重要的是六价钼，植物能吸收的；低价钼包括五价和五价以下的钼，则植物不能吸收利用。各种形态的钼互相转化，在酸性条件下，水溶态钼常转化成氧化钼。